محمد المختار الخليل حاصل على دكتوراه العلوم السياسية، وينصب تخصصه فيها على الجغرافيا السياسية، ومن قبل حصل على الماجستير في العلوم السياسية، مع التركيز في البحث على القانون الدستوري عام 1997 من جامعة أم درمان الإسلامية بالخرطوم.
تخرج بالإجازة في القانون العام (تخصص علاقات دولية) ومن قبل نال دبلوم الدراسات القانونية العامة من جامعة نواكشوط عام 1988.
عمل في الصحافة في موريتانيا منذ 1989، ومن ثم في قطر منذ 1997 صحفيا فرئيسا للقسم السياسي بجريدة الشرق، قبل أن يلتحق بشبكة الجزيرة في فريق تأسيس موقعها على الانترنت منتصف مايو عام 2000، تولى خلالها منصب سكرتير التحرير في يونيو 2001، ثم مساعدا لمدير التحرير فمديرا للتحرير مطلع يونيو 2010.
عين في يناير 2018 مديرا لمركز الجزيرة للدراسات.
بالإضافة للخبرة الصحفية يمتلك خبرة أكاديمية وتدريبة واستشارية في مجالي الصحافة والعلوم السياسية، خاصة في الصحافة الإلكترونية والتحرير الصحفي وإنشاء وإدارة المؤسسات الإعلامية، وكما يمتلك خبرة تدريبية واستشارية في العلاقات الدولية والجغرافيا السياسية للوطن العربي ومنطقة غرب إفريقيا. وقدم العديد من دورات معهد الجزيرة للإعلام منذ تأسيسه وإلى الآن.
